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大明永历元年八月（西历1647年，清顺治四年），朱由榔君臣筹到救急的粮饷后不久，天下的局势对大明已是非常不利了。
由于四川督师王应熊意外病故，川南一地的大小军阀割据自雄。四川因为距离明廷中枢太远，又长期处于抗清前线，朝廷鞭长莫及，武将大多军阀化了，而四川督师王应熊又意外病死，没了文臣大吏制约，大小军阀根本不听朝廷的号令，朝廷对四川几乎失去了控制。
在这种局面下。必须再任命一位德才兼备的四川督师以收拾残局，朱由榔考虑再三，决定起用赋闲在乡的文安之担任四川督师。
文安之，天启二年进士，曾任南京司业、祭酒。后为权臣薛国观弹劾，罢官家居。南明福王起为詹事，唐王召为礼部尚书，都因交通不便，未就职。
朱由榔起用文安之，靠的就是预知历史的前瞻性，在真实的历史上，文安之在永历三年奔赴行在，为联络川中诸镇之兵，自请担任四川督师，走到到贵州都匀时，为孙可望所拘。数月后脱身到川东，联络川鄂边境的义军——夔东十三家抗清。独撑危局。一直坚持到1659年，政治能力很强。
其资历和能力都足够担任封疆大吏。而且其在湖北三峡，由湖北入四川也也比较方便。
云南的情况也比较糟糕。
由于土司沙定洲作乱。云贵总督和云南巡抚都当了沙定洲的俘虏，沙定洲占领昆明以后，自称“总府”，“总府”是明黔国公世爵的一般称呼。其妻万氏称主母。“并舆出入，遍谒缙绅。滇中豪右投为谋划者甚众”。沙定洲派兵追拿沐天波，在楚雄被杨畏知集结的军队击败。他在西进失利之后，发兵收取云南各地，在不长时间里除了杨畏知、沐天波控制下的楚雄以西地区外，都归附了沙氏。
沙定洲轻而易举地攫得了沐府累世蓄积的财富。“沐氏世镇云南，府藏盈积。佛顶石、青箭头、丹砂、落红、琥珀、马蹄、赤金皆装以箧，箧皆百斤，藏以高板，板库五十箧，共二百五十余库，他珍宝不可胜计。定洲运入本峒，累月不绝”。他因此发了一大笔横财。
云南距离广东太远，千里迢迢，道路崎岖，朱由榔也没有太好的办法，只能尽力补救，他诏令云南副使杨畏知出任云贵总督，协调各地土司剿灭沙定洲。
在云南这个地方，黔国公沐天波的地位无可替代，大小土司都只认黔国公的世袭铁券，沙定洲虽然占领了昆明，但是沐天波带着世袭铁券和官印孤身逃走，其他的土司都不服沙定洲。