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很快，袁继咸离开了南京，入京担任首辅大学士兼任户部尚书，户部尚书黄宗羲则是出任江南省总督，如今江南省乃是朝廷一等一重要的地方，特别是开一带风气之先，除了应天学院之外，同样出现了苏州学院与芜湖学院，都是以培养实务人才为主要方向的学府，同样，儒家与西洋派的矛盾也是最为激烈，黄宗羲作为一代文宗，同样是精通百家，于算数、天文、地理等学科有着精深的造诣，没有多少独尊儒术的古板观念，让他前往江南省坐镇，可以很好的平息江南省的纷争。
至于袁继咸，袁继咸久历地方，从知府到布政使、总督，全部都干过，甚至还指挥着大军围剿过张献忠，绝对算得上是一个能臣了，让他担任首辅，下面有李岩跟徐一帆等人协助，却也不会出什么漏子。
朝廷政令在各地新的官员到位之后，开始恢复了稳定。
这个时候，远征漠北的天威军也开始返回京城，留下了满蒙新镇坐镇漠北，震慑漠北三部跟罗刹兵，以现在满蒙新镇的超强装备，除非罗刹国派来主力大军，不然的话，不可能动摇大明在漠北的强势地位。
查栓的大明舰队也开始返回南京城，刚刚回到了南京城就被朱杰召回了京城，朝廷要筹建海军部，将海军舰队从兵部独立出去，查栓已经熟悉了海军的情况，那是统管海军的不二人选，至于东瀛，有朱舜水以及天雄军坐镇，倒也安生得很，西洋各国只为了发财，在东瀛青山幕府与明军的强势掌控之下，他们可没有这个时候觊觎东瀛的打算，赚点银子可以，如果要侵略东瀛，只怕大明帝国那是要玩命的。
查栓一回到京城，就在朱杰的授意之下，开始重新整编大明海军，如今已经不是大明舰队一支舰队了，已经诞生了第二个序列，第一舰队与第二舰队，为了能够让第二舰队尽快形成战斗力，朱杰将郑浩天放在了第二舰队，让郑彩协助郑浩天，与此同时，向着第二舰队调拨第一舰队五艘天级战舰，十艘地级战舰，其余大小舰只二十艘，一下子分走了原来大明舰队近三分之一的战力；第一舰队则是交给了杨耿统领，如今的杨耿也成了提督，两个舰队开始形成一南一北，遥相呼应的形式。
一切都步入了正轨，朱杰的心思终于沉静了下来，可以将精力方才未来的发展上了。
从自己一到这个世界上，一直到现在，自己虽然给大明的武器带来了一些变革，但是能够取得一场场战争的胜利，依靠的不是武器上的优势，乃是天威军的彪悍战力以及拥有着一群能征善战的猛将，可是，这并不代表，未来大明可以高枕无忧，并不代表，如今的天威军可以一直无敌下去，可以说用不了太长的时间，西洋就会出现大量的燧发火枪以及开花炮，毕竟现在西洋也已经出现了这些武器，只不过还没有开始大量的装备军队，甚至，现在已经开始进行大量装备了。
在朱杰的记忆力，当年的英荷大战，荷兰人可是没少动用开花炮，至于燧发火枪也开始进行大规模的参战了，也就是说，与荷兰、英格兰、法国相比，大明如今装备的武器与西洋强国没有太大的差别，最多三到五年的时间差距，一旦双方投入大战，发现武器装备劣势的西洋强国会在短时间内装备已经出现的新式武器，缩小双方的差距。
不保险，很不保险，如今海军的战力无法获得绝对的优势，如果武器也不能战局绝对的优势的话，那大明想要与西洋个强国抗衡，会有不小的难度的，毕竟到了世界范围内，大明面对的可是整个西洋，人家西洋各国必定会抱团与大明帝国对抗的，毕竟大明算是地地道道的外来户，人家关起门，那就是自家人了。