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宇智波一族曾经是木叶村中最强大的两大家族之一，始创者是被誉为最强忍者、与千手柱间同为木叶始创人之一的宇智波斑。族员大多擅长火遁忍术，比如基本的火遁·豪火球之术和火遁·凤仙火之术。部分家系的族员具有血继限界写轮眼，在战斗中赋予他们强大的洞察力（复制敌人的忍术）和一些独特的瞳术。
据斑所说，宇智波一族在二代火影在位时期，二代火影为表达对宇智波一族的信任，允许他们创立了维护木叶治安的木叶警察部队。
宇智波一族的衰落是从木叶开始之初便已有萌芽，当年宇智波与千手两族为宿敌，两国交锋，一国雇佣宇智波，另一国则必定雇佣千手（因为能与宇智波匹敌的也只有千手一族了），两族长年交锋，双方均疲惫不堪。后来在初代火影柱间的提议下，两族达成休战协议，并联手创立了木叶忍者村。
但是在争夺村子领导权的问题上，宇智波斑妄图挑起战乱，遭到族人们的一致反对，最终被族人们所背叛，最终，宇智波一族驱逐了他们的族长，使斑无法再在木叶安身，斑失望之余最终离开了木叶，然后向木叶复仇，却被初代火影千手柱间所阻止，众人皆以为他已死，却不料到斑依然还活着，并且有了新的计划和野心。斑下落不明之后，宇智波一族便开始长期被置于木叶高层的监视之下。
十六年前的九尾之乱是由斑引起的，然而没有人知道斑还活着，但能操控九尾的只有宇智波一族特有的血继限界写轮眼，于是木叶上层对宇智波一族表示怀疑并将他们驱逐至村子一隅安住。终于在三代火影在位时期，宇智波一族开始策划叛变，夺取村子的领导权，而主谋者正是佐助与鼬的父亲。为了顺利夺权，鼬被其父亲宇智波富岳逼迫进了木叶暗部卧底。
刺探木叶上层的情报与动向，同时，木叶利用鼬热爱和平之心令其反过来监视宇智波，鼬从小目睹了第三次忍界大战的惨状，战争就是地狱的思想早已深深印入了他的脑中，他心中明白，如果像宇智波这么一个大家族发动政变的话，将会大大动摇木叶乃至火之国的根基，到时候别的国家就会有机可乘，甚至会引发第四次忍界大战，宇智波一族利己的思想将会害死很多无辜的人。
于是，鼬背叛了宇智波一族，将宇智波一族叛变的情报泄露给了木叶高层。最终，木叶高层给了鼬一个机密任务——杀光宇智波一族的所有人，并说，如果你不动手，宇智波一族将由暗部进行抹杀。鼬权衡利弊，为了守护来之不易的和平，为了能够保护弟弟佐助，保护宇智波一族的名誉，最终选择了大义灭亲，联合宇智波斑降下宇智波一族帷幕。
佐助碰到了被秽土转生出来的哥哥鼬，于是追了上去，并与鼬找兜，并与兜展开了决斗，没想到兜学会了使用仙人模式，还学会了重吾水月香磷的绝招，最后鼬又使用了禁术：伊邪那美！控制住了兜，秽土转生已被破解开,而这也意味着鼬和佐助的再一次见面终止，在自己消失之前，鼬把自己的记忆展示给了佐助并且表示不管弟弟做出什么选择他都深爱着佐助，最后两兄弟额头相碰，兄弟之情再次升华。
想知道真相的佐助复活了大蛇丸，和他一起去寻找“知晓真相的人们“——历代火影。大蛇丸复活了1至4代的火影后佐助询问初代千手柱间他到底是应该摧毁伤害了鼬的木叶还是保护鼬所珍惜的木叶。千手柱间决定向佐助讲述他和斑的故事。听完故事后的佐助决定保护木叶，和历代火影一起去了战场。。。。
写轮眼，宇智波一族的血继限界。写轮眼也称为心灵写照之眼。
在忍界的上古时代，传说中拥有六道轮回之眼和忍界神器（八咫镜、八尺琼勾玉）的六道仙人创立了所有忍术和整个忍界的秩序。六道以自已的身体为人柱力成功地把创世之初拥有最强查克拉的无双魔兽——十尾瞳兽封印成为月亮，并将十尾的查克拉分别分配到了守鹤、猫又、矶抚、孙悟空、穆王、犀犬、重明、牛鬼、九喇嘛这九只尾兽身上，而整个封印系统的方法也秘密地流传下来，从而拯救世界于危难。
然而在整个封印完成之后，六道轮回眼的性质也发生了变化，每一道轮回上都产生了勾玉，成为“被诅咒的眼睛”。然后六道在死亡之前有了两个孩子，并各自继承了仙人之力。长子（即是宇智波一族的始祖）继承了仙人之眼而次子（即是森之千手一族的始祖）继承了仙人之体。