故事发生在一个蒸汽机开始推广，资本主义开始抬头的架空世界。年轻作家因为取材的关系来到荒废的学园岛，调查三年前一起师生神秘死亡的事件。故事以遗留在岛上的某位遇难学生的日记为线索展开。随着故事的推进，主人公也逐渐开始发觉这起事件与自己幼时消失的记忆有所关联。究竟在这个科学还不普及，魔法依然存在的世界里发生了什么？